Разработчики domain-neutral архитектуры представили результаты тестирования системы, которая генерирует исследовательские гипотезы «слепым» способом. В отличие от предыдущих тестов в физике частиц, в этом прогоне система работала с фармацевтическим доменом, проверяя способность находить новые комбинации мишеней, модальностей, способов введения и показаний заболеваний.

Результаты тестирования гипотез

В ходе эксперимента система выдала 12 координат. Анализ литературы после «заморозки» гипотез показал, что пять из них совпали с уже опубликованными научными данными (положительный контроль), три были отклонены по научным причинам, а четыре оказались «исследовательским пробелом» (research gap) — для них не было найдено точных совпадений в целевом поиске.

Важным достижением стало то, что система смогла определить случаи, когда имеющихся параметров недостаточно для объяснения данных. Это позволило выявить необходимость расширения пространства поиска, что уже привело к росту реестра параметров фармацевтического домена с 44 до 59.

Ключевые научные кандидаты

Среди наиболее содержательных гипотез выделены три направления, требующих независимого подтверждения:

  • TWIST1 + siRNA: использование малых интерферирующих РНК для точечного выключения внутриядерного фактора TWIST1 в кардиальных фибробластах при фиброзе миокарда (HFpEF). Новизна заключается в комбинации мишени и метода для прерывания патологической обратной связи.
  • USP30 + PROTAC: использование бифункциональных молекул-деградеров вместо обычных ингибиторов. PROTAC не просто блокирует активный сайт фермента USP30, а полностью удаляет белок из клетки через систему убиквитинирования, что может дать более выраженный терапевтический эффект при фиброзе печени или почек.
  • LOXL3 + siRNA: воздействие на фермент LOXL3 для предотвращения сшивки коллагена, которая превращает мягкую ткань в жесткий рубец. Это рассматривается как потенциальный метод лечения стриктур при болезни Крона.

Границы возможностей системы

Авторы подчеркивают, что представленные результаты — это не список готовых лекарств, а исследовательские гипотезы. Система доказала умение ориентироваться в существующем научном пространстве и находить неопубликованные сочетания, но она еще не прошла тест на систематическое расширение пространства за счет генерации принципиально новых параметров. Следующим этапом станет проверка способности системы восстанавливать научные открытия, сделанные после даты отсечки её знаний.